Berdasarkan Permenristekdikti No.28 Tahun 2015. Tgl. 10 September 2015, Struktur Organisasi Universitas Tanjungpura terdiri dari:

1. Senat Universitas;

2. Dewan Penyantun;

3. SPI;

4. Unsur Pimpinan Universitas :

  1. R E K T O R : Prof. Dr. Thamrin Usman, DEA
  2. Pembantu Rektor I (Bidang Akademik) : Dr. Aswandi
  3. Pembantu Rektor II (Bidang Umum dan Keuangan) : Dr. Rini Sulistiawati, S.E., M.Si.
  4. Pembantu Rektor III (Bidang Kemahasiswaan dan Alumni) : Prof. Kamarullah, S.H., M.Hum.
  5. Pembantu Rektor IV (Bidang Perencanaan dan Kerja Sama) : Prof. Dr. Arkanudin, M.Si.

5. Biro Akademik dan Kemahasiswaan (BAK) : Drs. Mansyur

  1. Bagian Akademik : Dra. Ida Fitria
    Sub Bagian Akademik dan Evaluasi : Drs. Miswanto
    Sub Bagian Registrasi & Statistik : Bambang Sugeng, S.Sos.
    Sub Bagian Sarana Pendidikan : Syaifullah, S.Kom
  2. Bagian Kemahasiswaan dan Alumni : Drs. Ishak
    Sub Bagian Minat, Bakat, Penalaran, dan Informasi Kemahasiswaan : M. Yunus, S.H., M.M.
    Sub Bagian Kesejahteraan dan Kemahasiswaan : Muhammad, S.H.

6. Biro Umum dan Keuangan (BUK) : Jamaluddin M. Yusuf, S.H.

  1. Bagian Umum : M. Ali, S.H.
    Sub Bagian Tata Usaha : Muhammad Suherdianto, S.T.
    Sub Bagian Rumah Tangga : Mohd. Nuh, S.E.
    Sub Bagian Barang Milik Negara : Agus Maulidi, S.E.
  2. Bagian Hukum dan Kepegawaian : Dra. Mardiana, M.M
    Sub Bagian Hukum dan Tatalaksana : Ali Sodikin, S.H., M.Si.
    Sub Bagian Pendidik : Eva Novianti Hesti Vera, S.T., S.E.
    Sub Bagian Tenaga Kependidikan : Abdul Muthalib, S.E., M.M.
  3. Bagian Keuangan : Dra. Herilasti Pujiningsih, M.M.
    Sub Bagian Anggaran Non Penerimaan Negara Bukan Pajak : Syarif Zulkifli, S.T., S.E.
    Sub Bagian Anggaran Penerimaan Negara Bukan Pajak : Fahrizal, S.E., M.M.
    Sub Bagian Akuntansi dan Pelaporan : Gunarto, S.H.

7. Biro Perencanaan, Kerjasama, dan Hubungan Masyarakat (BPKHM) : Dra. Rien Pantekostani, M.Si.

  1. Bagian Perencanaan: Bujang Harun, S.Sos., M.Si.
    Sub Bagian Perencanaan Program dan Anggaran : Hafi, S.Sos., M.Si.
    Sub Bagian Evaluasi Pelaksanaan Program dan Anggaran : Muhammad Rifaat, S.T.
  2. Bagian Kerjasama dan Hubungan Masyarakat: Dra. Maimunah
    Sub Hubungan Masyarakat : Kasturi, S.IP.
    Sub Kerjasama : Agus Mirza, S.T., M.T

8. Fakultas, Jurusan dan Program Studi (PS)

9. Lembaga dan Pusat Studi/Penelitian/Kajian/Badan/Klinik :

  1. Lembaga Penelitian dan Pengabdian Kepada Masyarakat (LPPKM) : Prof. Dr. Eng. Ir. Ismail Yusuf, M.T.
    Sekretaris LPPKM : Ir. Surachman, MMA
    Tata Usaha LPPKM : Drs. Mohtar Loni
    Sub Bagian Program, Data, dan Informasi LPPKM : Drs. Kastani
    Sub Bagian Umum LPPKM : Dra. Ani Masriani
  2. Lembaga Pengembangan Pembelajaran dan Penjaminan Mutu (LPPPM) : Prof. Dr. Aunurrahman, M.Pd.
    Sekretaris LPPPM : Ir. Sofyan Z., M.Si.
    Tata Usaha LPPPM : Ir. Jumiati, M.M.
    Sub Bagian Program, Data, dan Informasi LPPPM : Ali Khan, S.H.
    Sub Bagian Umum LPPPM : Dra. RR. Mujiharti Rahayu

10. Unit Pelaksana Teknis (UPT) :

  1. UPT Perpustakaan : Septiana Bahraini, S.E.
  2. UPT Teknologi Informasi dan Komunikasi (TIK) : Dr. Herry Sujaini, S.T., M.T.
  3. UPT Laboratorium Terpadu : Rudiyansyah, S.Si., M.Si., Ph.D.
  4. UPT UPT Bahasa : Stella Prancisca, S.Pd., M.Pd.